Stojanovo gymnázium se nachází v budově bývalého velehradského kláštera, který byl v předchozích letech nově rekonstruován.  Škola má k dispozici vlastní školní kuchyň s jídelnou. V rámci výdeje stravy je schopná zajistit výdej snídaní, obědů, večeří.

Výchova na tomto typu školy vychází z principů křesťanské víry. Je zaměřena tak, aby ukazovala, že křesťanské morální zásady vycházejí ze základů víry. Zásady křesťanské morálky by měly být žákům představovány ne jako něco negativního, ale naopak jako pozitivní životní orientace.